首先，貨物性質及數量決定集裝箱海運價格。顯然，運價的高低是按貨物種類的不同而定，通常貨物本身價值高者其運費率亦較價值低的貨物的運費率高;貨物積載因數的不同影響到艙容的利用率，自然運費率亦不同;貨物批量少的運價通常要高于大批量的貨物運價;貨物數量的多少也影響艙位和船舶噸位的利用率。當會造成較大運力浪費時，其運價亦應較高。
其次，貨物始發地和目的地決定集裝箱海運價格。貨物始發地與目的地的不同涉及到港口水深、裝卸作業條件、港口使費水平、港口間的計費距離、航次作業時間的長短以及是否需要通過運河、航線上是否有加油港及當地的油價等眾多因素影響航線成本與營運經濟效益。顯然，港口及航線條件好者因船舶經營者能以較低的成本獲得較好的效益其運費率亦應低于條件差者。
第三，訂解約與裝貨準備完成日期決定集裝箱海運價格。當時的市場外部條件會有較大的差異，市場供需情況也會有不同，訂約日期和解約日期都會影響運費率的高低。此外，合同期的長短不同，也影響著運價的高低，長期運輸合同洽商的運價通常要低于短期合同。
第四，使用的船舶。使用船舶不同決定集裝箱海運價格，它們的適航性及適貨性均不同，故運費率就應不同;使用船舶不同，它們的技術狀況、安全保障狀況也不同，故國際上常根據是否持有船級來決定運費率以及保險費等;使用船舶不同，它們的成本構成項目也不同，故與成本直接有關的運費率也必定不同。
第五，競爭對手決定集裝箱海運價格。在市場經濟條件下，競爭對手的多少、他們實力的大小以及自己在市場中的實力，對于運費率的高低影響極大。在運輸市場中，競爭對手不僅有不同的航運經營者，還涉及到航運經營者與其它運輸方式經營者之間的競爭。他們各自通過調整運價的高低來保證自己能夠取得盡可能大的貨運份額。
第六，其它因素決定集裝箱海運價格。航運業，尤其是國際航運業已越來越受到各國政府和地區的干預和保護，故政府的各種措施都會影響到運價水平。在匯率波動幅度較大的時期，航運經營者為避免匯率風險所造成的經濟損失，往往要在制定運價時加以考慮，或在合同附則中補充特別規定等。
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