杭州某新材料公司，在杭州海關稽查中被發現申報內銷貨物和實際貨物不符，由于案值較大，被處罰20萬元。該企業進口料件種類不多，但還是使用了按項號歸并，將純度不同的相同物質歸入同一項號中。其中一種為100%純度的化學材料，一種為純度為87.5%的化學材料，前者的價格更高。加工貿易手冊核銷時，有結余料件，向海關申報內銷補稅，該企業申報商品名稱為純度較低的化學材料，內銷價格也相對較低。經海關核查，實際結余的料件為100%純度的化學材料。企業由于違反相關加工貿易內銷規定，被海關處罰。
根據總署211號令，審定內銷保稅貨物完稅價格辦法第四條進料加工進口料件或者其制成品（包括殘次品）內銷時，海關以料件原進口成交價格為基礎審查確定完稅價格。如果企業沒有如實申報內銷商品的名稱，規格型號，就算按結余數量補稅完畢，還是有偷漏稅違規的風險。
加工貿易手冊/賬冊按項號歸并，同一項號中有多種商品編碼相同但規格型號不一致的料件。在結余料件內銷時不能隨意選一個料件補稅，更不能選一個價格最低的料件補稅。而是按實際結余的料件，無法確定進口批次的，要使用手冊使用期間的進口加權平均價格申報補稅。內銷是海關稽查的重點內容，相關的結余料件清單，價格依據，計算方法，報關單證都要歸檔保存三年。
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